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Journal articles
A pipeline to translate glycosaminoglycan sequences into 3D models. Application to the exploration of glycosaminoglycan conformational space
Nikos Karamanos Zoi Piperigkou Achilleas Theocharis Hideto Watanabe Marco Franchi Stéphanie Baud 1 Stephane Brezillon 2 Martin Götte 3 Alberto Passi Davide Vigetti Ralph Sanderson Thomas Neill Thomas Iozzo Olivier Clerc 4 Julien Mariethoz 5 Alain Rivet 6 Frederique Lisacek 5 Serge Pérez 7 Sylvie Ricard-Blum 8
2
Laboratoire de Biochimie Médicale et Biologie Moléculaire
MEDyC - Matrice extracellulaire et dynamique cellulaire - UMR 7369
8
ASPE - Assemblages Supramoléculaires Péricellulaires et Extracellulaires
ICBMS - Institut de Chimie et Biochimie Moléculaires et Supramoléculaires
Nikos Karamanos
Author
ORCID : 0000-0003-3618-0288
Zoi Piperigkou
Author
Achilleas Theocharis
Author
Hideto Watanabe
Author
Marco Franchi
Author
ORCID : 0000-0003-4133-3031
Stéphanie Baud 1
Author
IdHAL : stephanie-baudORCID : 0000-0002-4436-0652IdRef : 09021806X
Stephane Brezillon 2
Author
Martin Götte 3
Author
ORCID : 0000-0003-2360-2496
Alberto Passi
Author
ORCID : 0000-0003-3328-3089
Davide Vigetti
Author
Ralph Sanderson
Author
Thomas Neill
Author
Frederique Lisacek 5
Author
Serge Pérez 7
Author
Sylvie Ricard-Blum 8
Author
ORCID : 0000-0001-9263-1851IdRef : 031554989
1
MEDyC - Matrice extracellulaire et dynamique cellulaire - UMR 7369 (Faculté de Médecine 51 Rue Cognacq-Jay 51095 REIMS CEDEX - France)
- URCA - Université de Reims Champagne-Ardenne : UMR 7369 (2 avenue Robert Schuman, 51100 Reims. - France)
- SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé) (Faculté de Médecine de Reims, 51, rue Cognacq Jay, CS 30018,
51095 Reims Cedex - France)
- URCA - Université de Reims Champagne-Ardenne : FED 4231 (2 avenue Robert Schuman, 51100 Reims. - France)
- UPJV - Université de Picardie Jules Verne : FED 4231 (Chemin du Thil - 80000 Amiens - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 7369 (France)
2
Laboratoire de Biochimie Médicale et Biologie Moléculaire (France)
- MEDyC - Matrice extracellulaire et dynamique cellulaire - UMR 7369 (Faculté de Médecine 51 Rue Cognacq-Jay 51095 REIMS CEDEX - France)
- URCA - Université de Reims Champagne-Ardenne : UMR 7369 (2 avenue Robert Schuman, 51100 Reims. - France)
- SFR CAP Santé (Champagne-Ardenne Picardie Santé) (Faculté de Médecine de Reims, 51, rue Cognacq Jay, CS 30018,
51095 Reims Cedex - France)
- URCA - Université de Reims Champagne-Ardenne : FED 4231 (2 avenue Robert Schuman, 51100 Reims. - France)
- UPJV - Université de Picardie Jules Verne : FED 4231 (Chemin du Thil - 80000 Amiens - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR 7369 (France)
3
Department of Obstetrics and Gynecology (Albert-Schweitzer-Str. 33;48129;Munster - Germany)
- UKM - University Hospital Münster - Universitaetsklinikum Muenster [Germany] (Albert-Schweitzer-Straße 33 Albert-Schweitzer-Campus 1, Gebäude:, 48149 Münster, Allemagne - Germany)
4
LISA - Lieux, Identités, eSpaces, Activités (UFR Drittu, Scenzi suciali, ecunòmichi è di gestioni 22, av. Jean Nicoli, BP 52 20250 Corti - France)
- UPP - Université Pascal Paoli (France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR6240 (France)
5
SIB - Swiss Institute of Bioinformatics [Lausanne] (Quartier UNIL-Sorge Bâtiment Génopode CH-1015 Lausanne - Switzerland)
- UNIL - Université de Lausanne (CH-1015 Lausanne - Switzerland)
6
CREOP - Centre de Recherches sur l'Entreprise, les Organisations et le Patrimoine (Université de Limoges Faculté de droit et sciences économiques 5 rue Félix Eboué 87000 LIMOGES - France)
- GIO - Gouvernance des Institutions et des Organisations (33 rue François Mitterrand
BP 23204
87032 Limoges - France)
- UNILIM - Université de Limoges (33 rue François Mitterrand BP23204 87032 Limoges - France)
7
FaMAF - Facultad de Matemática, Astronomía y Física [Cordoba] (Facultad de Matemática, Astronomía y Física Universidad Nacional de Córdoba Medina Allende y Haya de la Torre Ciudad Universitaria 5000, Córdoba Capital, Córdoba, Argentina - Argentina)
- Universidad Nacional de Córdoba [Argentina] (Av. Haya de la Torre s/n - Pabellón Argentina - Argentina)
8
ASPE - Assemblages Supramoléculaires Péricellulaires et Extracellulaires (UMR 5246 CNRS Université Lyon 1- ICBMS Bâtiment Raulin
2ème étage Nord Université Claude Bernard Lyon 1
43 Boulevard du 11 novembre 1918
69622 Villeurbanne Cedex - France)
- ICBMS - Institut de Chimie et Biochimie Moléculaires et Supramoléculaires (ICBMS UMR 5246 CNRS, Université de Lyon, Université Lyon 1, CNRS, INSA Lyon, CPE Lyon, bâtiment Lederer, 1 rue Victor Grignard, 69622 Villeurbanne Cedex, France - France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- CPE - École Supérieure de Chimie Physique Électronique de Lyon (Domaine Scientifique de la Doua Bâtiment Hubert Curien 43 Boulevard du 11 Novembre 1918 69616 Villeurbanne - France)
- INSA Lyon - Institut National des Sciences Appliquées de Lyon (20 Avenue Albert Einstein,
69621 Villeurbanne cedex - France)
- Université de Lyon (92 rue Pasteur - CS 30122, 69361 Lyon Cedex 07 - France)
- INSA - Institut National des Sciences Appliquées (France)
- INC - Institut de Chimie du CNRS (3 Rue Michel-Ange 75 016 Paris - France)
- CNRS - Centre National de la Recherche Scientifique : UMR5246 (France)
- UCBL - Université Claude Bernard Lyon 1 (43, boulevard du 11 novembre 1918, 69622 Villeurbanne cedex - France)
Document type :
Journal articles
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https://hal-udl.archives-ouvertes.fr/hal-02109760
Contributor : UMR5246 ICBMS Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Thursday, April 25, 2019 - 10:00:09 AM
Last modification on : Saturday, June 25, 2022 - 10:09:27 AM
Contributor : UMR5246 ICBMS Connect in order to contact the contributor
Submitted on : Thursday, April 25, 2019 - 10:00:09 AM
Last modification on : Saturday, June 25, 2022 - 10:09:27 AM
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Identifiers
- HAL Id : hal-02109760, version 1
- DOI : 10.1093/glycob/cwy084
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UNILIM | UNIV-CORSE | CNRS | UNIV-LYON1 | URCA | INSA-LYON | UNIV-CORSE-LISA | INC-CNRS | MEDYC | ICBMS | INSA-GROUPE | UDL | U-PICARDIE
Citation
Nikos Karamanos, Zoi Piperigkou, Achilleas Theocharis, Hideto Watanabe, Marco Franchi, et al.. A pipeline to translate glycosaminoglycan sequences into 3D models. Application to the exploration of glycosaminoglycan conformational space. Glycobiology, Oxford University Press (OUP), 2019, 29 (1), pp.36-44. ⟨10.1093/glycob/cwy084⟩. ⟨hal-02109760⟩
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